| 名称 |
厂家 |
型号 |
| 扫描浏览软件 |
3DHISTECH（Hungary） |
CaseViewer2.4 |
| 图片分析软件 |
Media Cybemetics（U.S.A） |
Image-Pro Plus 6.0 |
| 图片分析软件 |
National Institutes of Health（U.S.A） |
ImageJ 1.51K |
| 扫描分析软件 |
3DHISTECH（Hungary） |
Quant Center2.1 |
| 扫描分析软件 |
Indica labs（U.S.A） |
Halo v3.0.311.314 |
| 统计软件 |
IBM（U.S.A） |
SPSS v20 |
| 绘图软件 |
GraphPad Software（U.S.A） |
GraphPad Prism 5 |
二、分析内容（如有除以下外其它分析要求可直接咨询）
1、组化/荧光分析【组化/荧光普通切片（扫描是分析整张切片或一个特定区域，拍照是分析每张切片中3张照片）；芯片组化扫描结果分析（对每个点独立分析，总点数小于200个点）；芯片荧光扫描结果分析（对每个点独立分析，总点数小于200个点）；芯片分析中如果要对每个点中特定区域单独分析，需提前说明】
面密度, 累积光密度值（IOD）/待测区域组织面积：累积光密度值是所有阳性信号光密度的积分，除以待测区域组织面积可反映阳性多少和深浅，成正比。优点是既考虑了阳性的面积以及阳性的深浅，且不受待测组织大小的影响。
阳性率，阳性细胞数/总细胞数：分析阳性细胞数占总细胞数的占比。反映阳性细胞数量比率高低，成正比。优点适用于细胞类型较单一的情况。比如肿瘤组织中KI67指标肿瘤细胞增值比率，脾脏组织内CD3指标T细胞比率等。
阳性细胞密度，阳性细胞数/待测区域组织面积：分析阳性细胞数占待测区域组织面积之比。反映单位面积内阳性细胞个数，成正比。优点不受多种细胞类型数量影响。常用在浸润型的炎性细胞中，比如肝组织中某类炎性细胞占比，代表性指标MPO、CD68等。
阳性强度，各阳性点颜色深浅的平均值：反映整张片子或者某个区域阳性的平均深浅度。明场为平均光密度（average optical density），暗场为平均强度（average intensity），数值越大阳性程度越强。适用性广，由于没有考虑阳性面积，在极端情况下会出现，阳性极少且颜色深时阳性强度值高，阳性点多且颜色浅时阳性强度值低。可以结合阳性面积一起评价。
阳性面积比，阳性面积/待测区域组织面积：不考虑阳性深浅的变化，单纯的比较阳性面积占比。
MVD，微血管数量/视野：单位面积内微血管数量，对于微血管的识别不需具备完整的管腔和红细胞，只要有明显的血管内皮细胞染色、并且能与相邻的血管、实质细胞以及间质成分相分隔的，就可视为一个独立的血管，分辨不清、管腔直径＞8个红细胞直径的血管以及具有较厚肌层的血管不纳入计数内。常用指标CD31、CD34。此项只能分析高倍视野的图片。
IRS评分：对免疫组化切片中的染色程度（0-3分）以及阳性率（0-4分）分别评分后相乘得到综合评分（0-12分）。具体如下，染色强度以目的细胞呈现染色特性计分：无着色为0分，淡黄色为1分，棕黄色为2分，棕褐色为3分；以细胞阳性比率进行计分：0～5%为0分，6%～25%为1分，26%～50%为2分，51%～75%为3分，>75%为4分。综合评分可划分阳性高低后进行统计，常用于癌和癌旁的芯片生存分析中。
H-Score：即 Histochemistry score （组织化学评分）的缩写，是处理免疫组化的一种组织学评分方法，将每张切片内阳性数量及其染色强度转化为相应的数值，达到对组织染色半定量的目的。H-Score（H-SCORE=∑（pi×i）=（percentage of weak intensity×1)+(percentage of moderate intensity×2)+(percentage of strong intensity×3)，式中pi表示阳性信号像素面积/细胞数量占比；i代表着色强度）。H-score为0-300之间的数据，数据越大说明综合阳性强度越强。
免疫荧光多标阳性共定位分析：测量整张扫描切片或者指定区域中单独通道的数据以及指定共定位的数据（阳性面积或阳性率值表示，选其一）。
免疫荧光空间距离分析：主要用来研究肿瘤微环境，炎性细胞和肿瘤细胞之间的距离关系等。
分析一种指标标记的细胞周围多少微米范围之内另一指标标记的细胞数量，可以设置不同范围；
以某处为界（如肿瘤灶、坏死灶或指定区域等）分析该区域多少微米范围之内不同指标标记的细胞数量，例如肿瘤周围500um内CD3阳性细胞的数量。
在显微镜下浏览切片或浏览数字切片，在不同倍数下详细观察组织切片情况，对切片中基本病理改变如充血、淤血、出血、水肿、变性、坏死、增生、纤维化、机化、肉芽组织、炎性变化等情况文字描述，并反映出片子之间的差异。对典型病变部位成像并在word文档中用箭头标识。报告大致分为四种类型。
病理描述类：每张切片提供相应典型视野图片（低倍和高倍），描述病理变化，并在word文档中用不同颜色箭头标注其典型病变特征。常用于需要对每张片子病理变化清楚展示或者无明确评分标准的情况。
病理评分类：每张切片提供相应病理评分（评分标准需由客户提前提供；如果无评分标准且客户确认后，可以由轻度到重度对病理改变进行主观打分），按分组提供相应典型视野图片，描述病理变化，并在word文档中用不同颜色箭头标注其典型病变特征。常用于已有特定评分标准或要对病理改变量化统计。
病理描述+评分类：既要每张切片都提供典型图片描述并标注，又要每张进行评分。
病理诊断类：根据提供的送样单上信息，给出具体判断结果，并提供判断典型图。适用于动物肿瘤定性，家禽疾病诊断等。
3、形态测量分析【根据常见分析方法不同，每个样本提供3-5个数据不等】
HE染色中测量各类结构长、宽、面积、数量以及密度等常规数据。以下为常规参考，不包含所有。
肠：小肠绒毛高度；小肠绒毛宽度；小肠隐窝深度；单位面积内隐窝数量；大肠肠腺深度；肠粘膜层厚度；肠肌层厚度。
肺：单位视野内肺泡数NA；单位视野内肺泡间隔数NS；支气管基底周径Pbm；支气管腔面积；支气管总管壁面积WAt；支气管内壁面积WAi；支气管平滑肌面积WAm。
卵巢：初级卵泡数量；次级卵泡数量；窦状卵泡数量；成熟卵泡数量；黄体数量；白体数量。该分析为扫描后整个卵巢切片计数。
皮肤：单位面积内毛囊数量；表皮厚度；真皮厚度；损伤深度；损伤宽度。
血管：管腔面积；管腔直径；内膜增生面积；中膜平均厚度；斑块面积。
睾丸：生精小管长短径；生精小管周长；生精小管面积；单位视野间质细胞数量。
心：横切心肌细胞面积；横切心肌细胞直径；横切心肌细胞密度；心室壁的平均厚度；心腔面积。
肌肉：横切肌纤维面积；横切肌纤维直径；横切肌纤维密度。
脂肪：脂肪细胞面积；脂肪细胞直径；脂肪细胞数量密度。
特殊染色中主要分析阳性面积以及占比或视野内阳性细胞个数。以下为常规参考。
Masson：胶原纤维面积/待测区域组织面积；胶原纤维IOD值。
Sirius red：胶原纤维面积/待测区域组织面积；偏振光下I型与III型胶原面积比率。
甲苯胺蓝：单位视野内肥大细胞密度；半薄切片髓鞘直径；半薄切片髓鞘厚度。
PAS：单位绒毛长度上杯状细胞数量；肾小球基质PAS阳性面积/肾小球面积。
高尔基（脑神经细胞）：树突与同心圆交点数（200倍），单位长度上树突棘密度（1000倍）。
大体油红（主动脉）：脂肪斑块阳性面积/血管组织面积。
Goldner（骨质疏松）：总的组织面积T.Ar；骨小梁面积Tb.Ar；骨小梁周长Tb.Pm；骨小梁面积百分比Tb.Ar；骨小梁厚度Tb.Th；骨小梁数目Tb.N；骨小梁分离度Tb.Sp。
植物根：根面积；根直径；外皮层厚度；皮层细胞厚度；内皮层细胞厚度；中柱面积；单位面积内导管数量；中柱内木质部面积占比。
植物叶：叶片厚度；叶肉厚度；角质层厚度；上表皮细胞厚度；下表皮细胞厚度；栅栏组织厚度；海绵组织厚度；泡状细胞数量；单位长度内叶脉数量；中脉中心厚度。
植物果实：角质层厚度；表皮厚度；亚表皮厚度；表皮细胞平均面积；亚表皮细胞平均面积；表皮细胞长宽；亚表皮细胞长宽；果肉细胞平均面积。
北京科沿有道生物科技有限公司，专注于生命科学最前沿科研技术服务，具有较好的生物学和医学技术服务平台，能够提供实验课题设计、论文编辑润色，以及细胞实验、动物模型、病理检测、分子实验、免疫检测、病毒包装、组学服务、基因编辑等整体课题一站式服务。
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