一、技术简介:
DNA pull down是用于分析蛋白质与DNA互作的一种分析技术。一般来说,该实验首先需要针对待研究目的基因的调控区域设计并制备特异性探针(以脱硫生物素标记为主流);同时,制备细胞核提取物;将探针和核提取物共同孵育,DNA结合蛋白就会和靶向序列特异性结合;然后,通过亲和素磁珠纯化蛋白质DNA复合物;最后针对获得的蛋白,使用WB验证或者质谱方式鉴定蛋白质类型。
二、技术优势:
高特异性:能够高度特异地富集与目标DNA序列相互作用的蛋白质,具有较低的背景干扰;
可定量分析:可对DNA-蛋白质相互作用进行定量分析,如荧光或放射性标记的探针,可测量结合的强度和亲和力;
适用于高通量分析:DNA pull-down技术可进行高通量分析,同时研究多个DNA-蛋白质相互作用,提供更全面的信息和更深入的洞察;
低样本量要求:仅需要少量的样本即可进行实验,对于限量样本或珍贵样本的研究具有重要意义;
适用范围广泛:可在不同实验条件下应用,包括体外和体内研究,适用于各种生物体系和细胞类型。它可以用于研究不同生物过程中的DNA-蛋白质相互作用,例如基因调控、DNA修复、染色质结构和功能等。无论是研究基础生物学还是疾病机制,DNA pull-down技术都具有广泛的适用性。
三、实验流程:
确定方案及样本接收→样本准备及处理→探针标记→蛋白与探针共孵育→WB检测或质谱鉴定→结果交付。
四、需提供材料及信息:
1、DNA序列相关信息或DNA过表达质粒;
2、细胞样品;
3、如WB检测则需提供特定蛋白一抗。
五、送样要求:
1、质粒至少提供10ug;
2、冻存细胞两只或复苏细胞两瓶;
3、动物或植物组织至少500mg;
4、细胞沉淀至少2*10的7次方。
注:除了复苏细胞常温运输以外,其他样品均干冰运输。
1、构建含目的基因的质粒、菌液,测序报告;
2、DNA Pull-down蛋白SDS-PAGE银染图;
3、WB检测报告/质谱鉴定分析报告。
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