转录组学之small RNA测序

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转录组即某个物种或特定细胞在某一功能状态下产生的所有RNA的总和,是研究细胞表型和功能的一个重要手段。与基因组不同的是,转录组的定义中包含了时间和空间的限定。同一细胞在不同的生长时期及生长环境下,其基因表达情况是不完全相同的。

转录组测序是指利用第二代高通量测序技术进行cDNA测序,全面快速地获取某一物种特定器官或组织在某一状态下的几乎所有转录本。相对于传统芯片而言,转录组测序无需预先设计探针,即可对任意物种的任意细胞类型的转录组进行检测,能够提供更精确的数字化信号,更高的检测通量以及更广泛的检测范围,是目前深入研究转录组复杂性的强大工具。

一、small RNA测序简介:

Small RNA 是一大类调控分子,包括:miRNA、ncRNA、siRNA、snoRNA、piRNA、rasiRNA 等,几乎存在于所有的生物体中。Small RNA通过多种多样的作用途径,如mRNA降解、翻译抑制、异染色质形成以及DNA去除,来调控生物体的生长发育和疾病发生。

Small RNA(sRNA)测序采用Illumina HiSeq平台,可针对样本中的miRNA、siRNA、piRNA 展开全面分析,既能鉴定已知sRNA、也能预测新的sRNA 并预测sRNA的靶基因,为研究smallRNA 功能及调控机制提供有力手段。

二、技术路线:

转录组学之small RNA测序

三、应用领域:

基因调控、疾病发生、染色体形态、生物生长发育。

四、样品要求:

样品类型
样品量
样品要求
total RNA
≥3.0ug
浓度≥200ng/ul

 

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hjg
  • 本文由 hjg 发表于 2024年11月11日 10:22:57
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