转录组学之cirRNA测序

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转录组即某个物种或特定细胞在某一功能状态下产生的所有RNA的总和,是研究细胞表型和功能的一个重要手段。与基因组不同的是,转录组的定义中包含了时间和空间的限定。同一细胞在不同的生长时期及生长环境下,其基因表达情况是不完全相同的。

转录组测序是指利用第二代高通量测序技术进行cDNA测序,全面快速地获取某一物种特定器官或组织在某一状态下的几乎所有转录本。相对于传统芯片而言,转录组测序无需预先设计探针,即可对任意物种的任意细胞类型的转录组进行检测,能够提供更精确的数字化信号,更高的检测通量以及更广泛的检测范围,是目前深入研究转录组复杂性的强大工具。

一、cirRNA测序简介:

circRNAs(Circular RNAs,环形RNA分子)是一类不具有5'末端帽子和3'末端poly(A)尾巴、并以共价键形成环形结构的非编码RNA分子。通过高效富集circRNA,借助最主流软件可以对circRNA进行参考序列比对、circRNA鉴定、circRNA来源基因分析、circRNA表达水平定量、差异表达分析、GO、KEGG富集分析、miRNA结合位点预测等。

二、技术路线:

转录组学之cirRNA测序

三、应用领域:

基因功能、基因表达调控、疾病发生、分子互作、ceRNA 网络等。

四、样品要求:

样品类型
样品量
样品要求
total RNA
≥5.0ug
浓度≥100ng/ul

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hjg
  • 本文由 hjg 发表于 2024年11月11日 14:11:08
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