DNA足迹分析实验(DNase I footprinting)主要用于鉴定DNA的结合蛋白(比如转录调控蛋白)在DNA分子上精确的结合位点。如转录调控蛋白是通过与启动子区域结合从而调控靶标基因的转录。常用的体外研究工具,一般是凝胶迁移实验(EMSA)和DNA足迹分析实验进行组合:凝胶迁移实验可用于确定转录因子是否与DNA有直接结合,而DNA足迹分析实验还可以精确鉴定与其结合的DNA序列,进而帮助我们研究基因转录的调控机制。以往DNase I足迹分析实验人们常用同位素来标记,不但危险,而且花费时间比较长、对操作技术要求较高、成功率低。
科沿有道生物采用“荧光标记”结合ABI测序仪的方法进行DNase I足迹分析实验。其优点有:可以精确定量DNA,且能在常规实验台上操作;可重复性好于同位素操作;另外ABI测序仪的操作体系已非常成熟,灵敏度高,重复性好。所以,荧光标记法有更高灵敏度,获得的保护区域也更加清晰,且图片的质量更好一些。

蛋白与探针结合→DNase I梯度酶切→ABI测序仪检测→确定检出的蛋白保护序列。
服务项目 |
说明 |
周期 |
探针制备及与蛋白结合 |
客户提供准确的DNA结合蛋白的序列范围序列,或根据文献设计探针合成 |
2周 |
DNase I梯度酶切 |
需要进行反复摸索条件达到对DNA部分酶切的效果。 |
3周 |
ABI测序仪检测 |
检测结果进行图片与数据处理,确定检出的蛋白保护序列,并提供可发表图片。 |
1周 |
1) 提供EMSA结果图及实验参数以便于接下来的DNase I足迹分析实验。
2) 完整的实验报告(含实验步骤、流程及试剂耗材厂家)。
北京科沿有道生物科技有限公司,专注于生命科学最前沿科研技术服务,具有较好的生物学和医学技术服务平台,能够提供实验课题设计、论文编辑润色,以及细胞实验、动物模型、病理检测、分子实验、免疫检测、病毒包装、组学服务、基因编辑等整体课题一站式服务。
科沿有道秉承“客户为先,服务至上”的经营理念,以一切为了客户的利益为宗旨,努力为广大客户提供最优质、高效的服务,科沿有道人用实实在在的优质实验技术换取客户的信任,相信在未来的工作中,科沿有道人一定能够成为您的得力助手和值得信赖的合作伙伴。
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