亚硫酸氢盐处理后测序(bisulfite sequencing PCR,BSP)法是检测基因甲基化的经典方法,其原理为:用亚硫酸氢钠修饰处理基因组DNA,所有未发生甲基化的胞嘧啶(C)被转化为尿嘧啶(U)而甲基化的胞嘧啶则不变。
基因组DNA经亚硫酸盐处理后,设计BSP引物扩增目的片段,此时尿嘧啶(U)全部转化为胸腺嘧啶(T),最后对PCR产物进行测序就可以判断CpG位点是否发生甲基化。
一、技术优势:
(1)检测序列长,可长达200-400bp;
(2)分辨率高,可检测到每一个碱基的甲基化状况;
(3)对于样品要求低,适用于新鲜、冷冻和FFPE样本。
二、服务内容:
(1)基因组DNA的Bisulfite转化;
(2)BSP(Bisulfite Sequencing PCR)法,包括引物设计与合成,TA克隆测序及数据分析。
三、样品要求:
(1)若提供基因组DNA,需≥2μg;
(2)若提供的材料为新鲜组织、血液、细胞等生物材料,需提供足够提取2μg以上基因DNA的材料量;
(3)基于所选择的DNA甲基化检测方法,需提供相应的引物或引物序列。
四、BSP服务完成时提供:
(1)Bisulfite处理的基因组DNA;
(2)实验报告(包括BSP产物的直接测序报告);
(3)5个有效的阳性克隆;
(4)空点图。
五、结果展示:
(1)BSP测序图:

(2)BSP点状图和BSP序列比对:

(3)BSP柱状图:

各类实验标本要求
序号 服务项目 标本要求 1 ELISA检测 血清、血浆、组织、细胞 2 普通生化(肝功、肾功及糖代谢如TP.ALB、Ca、P、Zn、Fe、AST、ALT.Cre、GLU、TC、TG、BUN、UA、H...
比较蛋白质组学之SILAC定量分析
SILAC ( Stable Isotope Labeling with Amino acids in Cell culture)技术是利用哺乳动物细胞增殖对必需氨基酸的依赖性原理而设计的代谢标记蛋白...
比较蛋白质组学之Label-free定量分析
Label-free是通过比较质谱分析次数或质谱峰强度,分析不同来源样品蛋白的数量变化,认为肽段在质谱中被捕获检测的频率与其在混合物中的丰度成正相关。因此,蛋白质被质谱检测的计数反映了蛋白质的丰度,通...
比较蛋白质组学之iTRAQ定量分析
iTRAQ(isobaric tags for relative and absolute quantitation)技术是由AB SCIEX公司研发的一种体外同重同位素标记的相对与绝对定量技术,利用...
我的微信
我的微信
微信扫一扫

评论