修饰蛋白质组学之乙酰化鉴定

蛋白质的乙酰化修饰是在乙酰基转移酶的作用下，蛋白质的赖氨酸残基上添加乙酰基的过程，是细胞控制基因表达、蛋白质的活性或生理过程的一种机制。乙酰化主要集中在对细胞染色体结构的影响以及对核内转录调控因子的激活方面，还参与细胞周期和新陈代谢、肌动蛋白聚合控制。乙酰化蛋白质组以组织、细胞等较为复杂样本为研究对象，目的在于鉴定样品中发生乙酰化的蛋白质以及相应的乙酰化位点。

一、技术特点：

（1）采用主流抗体亲和富集方法，特异性高，富集效率好；

（2）通过高分辨率、高扫描速度的质谱，对富集的乙酰化肽段进行大规模鉴定；

（3）结合常用的定量技术可对不同样品间的乙酰化水平差异进行定量比较。

二、适用范围：

（1）药物作用靶点研究；

（2）疾病标志物筛选；

（3）植物胁迫/抗逆研究；

（4）作用机制研究；

（5）要求物种具有蛋白质参考数据库、EST序列（转录组）或基因组注释信息。

三、实验流程：

（1）蛋白提取；

（2）肽段酶解；

（3）乙酰化富集；

（4）HPLC分离；

（5）LC-MS/MS；

（6）数据解析；

（7）结果交付。

四、需提供：

（1）需鉴定的样品；

（2）样品信息：需详细说明样品来源、含量、状态及其他基本信息。

五、结果交付：

（1）实验报告一份，含具体实验流程及蛋白质组鉴定及定量结果（生物信息学分析）。

（2）生物信息学分析内容包括：

①修饰蛋白、修饰位点鉴定；

②鉴定结果特征分布：肽段长度、蛋白覆盖度分布、unique肽段分布；

③修饰位点motif预测；

④蛋白质GO功能分类、COG注释、Pathway通路注释；

⑤蛋白质网络互作预测（高级分析）；

⑥蛋白质Domain预测（高级分析）；

⑦蛋白质亚细胞定位（高级分析）。

六、实验周期：

自送样起40-60个工作日。